內視鏡超音波(endoscopic ultrasound，簡稱EUS)是利用內視鏡讓超音波探頭深入靠近檢查的部位，避開腸氣之干擾，同時使用較高頻率的探頭提高解像力，更能偵測或分辨微小的病灶，為診斷、治療胰臟與總膽管疾病的重要工具。例如：細針穿刺的細胞學診斷、胰臟假性囊腫的引流、胰臟癌的局部注射化學療法，或神經節阻斷止痛療法等。

而隨著器械及操作技術進步，治療性內視鏡已成為多數消化道疾病的常規療法，台北慈濟醫院胃腸肝膽科將內視鏡治療廣泛應用於食道、胃等消化道病灶與早期癌症，如：上消化道出血止血術、食道或胃靜脈瘤出血止血術、內視鏡總膽管結石取石術、消化道惡性廔管金屬支架放置術、消化道早期癌症黏膜下剝離術、內視鏡十二指腸乳突腫瘤切除術、消化道早期癌症射頻燒灼術、內視鏡超音波導引下腫瘤消融術、內視鏡超音波導引下神經節阻斷術等。

以「內視鏡熱射頻燒灼術」治療早期食道癌為例，此技術治癒率約達九成，適用於治療早期食道癌及巴雷特氏食道。為患者全身麻醉時，以內視鏡方式，將儀器360度的環狀電擊探頭或90度的扁平電擊探頭置入患者食道病灶處，燒灼病變癌細胞的技術。燒灼後，醫師刮除脫落的病灶表皮，數周後，該病變部位將會再生出新的正常細胞。此種做法可大範圍地根除早期食道黏膜內腫瘤，讓病人免於食道腫瘤切除手術。