本院由「社區暨長照服務部」負責社區健康促進推動，辦理社區健康講座、整合式篩檢、義診及各項社區健康促進活動，並於健康促進推動委員會監督下共同推動，指導社區民眾正確的健康觀念及知識，提供健康諮詢與衛生教育。
每年依區域內地理環境、人口結構以及民眾就醫情形，訂定推動長者健康促進、落實健康促進醫院、高齡友善醫療服務、社區防疫推廣、健康社區推動及偏鄉醫療服務等六大目標之年度社區醫療服務暨健康促進相關計畫。2016年至2019年共辦理6,799場整合式篩檢、老人健檢、疫苗接種、偏鄉義診與健康講座等活動，服務近34萬人次。
臺北慈濟醫院同時為衛生福利部國民健康署認證之「健康醫院」，積極堆動員工與社區民眾身心靈健康促進，每年相關成果均於國際健康促進年會發表。相關社區服務與健康品質認證如下：
- 2010年取得WHO(World Health Organization)健康促進醫院國際網絡會員資格，並通過新北市政府衛生局健康促進醫院認證。
- 2011年通過國民健康署高齡友善照護機構認證及無菸醫院金獎肯定。
- 2016年獲選為「戒菸服務品質改善措施」績優醫事機構。
- 2018年獲新北市政府衛生局「戒菸服務 功在新北」。
- 2018年通過國民健康署健康醫院認證-高齡友善健康照護機構認證、無菸醫院認證、低碳醫院認證。
- 獲台灣國際醫療衛生促進協會第二屆「國際醫療典範獎」團體組。
- 癌症醫療品質提升計畫2016年新北市政府衛生局頒發癌症品質提升醫院，本院在大腸篩檢名次為第一名(篩檢量新北市最多)及乳癌篩檢績優獎。
- 社區防疫推廣計畫：2016-2019年皆獲新北市政府衛生局「協助校園流感疫苗接種」感謝狀。獲新北市政府衛生局「預防保健 功在新北」。
- 偏遠地區暨弱勢族群關懷服務：2017-2020年皆獲台灣盲人重建院「協助丙級按摩養成班職場實習課程」感謝狀。
2016年起，臺北慈濟醫院徐榮源副院長擔任慈濟北區人醫會總召集人，有效結合醫院與社區資源，凝聚更多美善力量，共同肩負國際人道救助與建立醫療外交的使命。
由社區走入山地偏鄉，臺北慈濟醫院同仁足跡踏遍新北市石碇、烏來、貢寮、瑞芳、雙溪、平溪、三芝，舉凡急診、內科、外科、兒科、家醫科、身心醫學科、復健科、眼科、營養科等各科同仁皆參與北台灣偏鄉巡迴醫療義診與往診；年服務約5,082 人次，彌補大臺北東南隅醫療資源之不足。並支援離島、澎湖望安鄉、金門義診，年服務約509 人次。