台北慈濟醫院之教研部成立於九十四年六月，下設研究組與教學組，二功能組於九十六年十月分別獨立為研究部及教學部。研究部下設行政辦公室、共同實驗室、動物室及人體生物資料庫，組織成員包括研究部主任1名，共同實驗室主任1名，專任博士級研究人員5名，碩士級研究人員3名、學士級研究人員3名、研究護理師1名及生物統計分析師1名。研究部主要之任務在提供即時必要之協助與支援，以提升本院之基礎醫學與轉譯醫學之研究能量。

主要職掌

• 承辦研究計畫相關業務
• 承辦臨床試驗執行之相關業務
• 承辦研究相關教育訓練
• 承辦人體生物資料庫相關業務
• 提供基礎與轉譯醫學研究之設施與貴重儀器操作服務
• 提供生物統計與研究諮詢服務
• 其他研究發展業務

研究發展業務接受「研究管理及發展委員會」之監督，並與「實驗動物照護及使用委員會」、「生物安全委員會」、「人體試驗審查委員會」、共同合作以促進本院研究之發展。

除了完整之基礎研究設備外，共同實驗室有多項貴重儀器設備以提供基因體學、蛋白質體學、細胞生物學及動物生理學之研究。貴重儀器之研究設備包括有變性快速液像(Denautured High Performance Liquid Chromatography) 、及時定量聚合酶連鎖反應系統(Real Time Quantitative PCR)、共軛焦螢光顯微鏡(Confocal Microscope)、雷射顯微擷取系統(Laser Capture Microdissection System)、流式細胞分析儀(Flow Cytometer)、液相質譜分析儀（LC/MASS/MASS）固相質譜儀(MALDI/TOF/TOF）、大小鼠超音波系統等等，部分貴重儀器亦提供院外研究人員之使用服務。

台北慈濟醫院積極鼓勵基礎與臨床之整合性研究及院內與院外及國際之研究合作，結合基礎研究人員、醫師及醫事人員成立研究團隊，期待整合不同領域之研究，積極攜手為人力健康福祉而努力。